Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox12Q04890 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms