Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms