Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RelaQ04207 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms