Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Runx1Q03347 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Runx1Q03347 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms