Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gjb5Q02739 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms