Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HmgcrQ01237 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms