Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gjb2Q00977 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms