Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbp1Q00915 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms