Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms