Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms