Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gfra1P97785 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms