Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
rp9P97762 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
rp9P97762 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
rp9P97762 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
rp9P97762 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
rp9P97762 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
rp9P97762 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms