Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tarbp2P97473 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms