Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cmklr1P97468 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cmklr1P97468 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cmklr1P97468 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cmklr1P97468 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Cmklr1P97468 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cmklr1P97468 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cmklr1P97468 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms