Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nbr1P97432 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nbr1P97432 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms