Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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