Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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