Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms