Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms