Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Smad1P70340 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms