Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms