Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf5P70191 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms