Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SbdsP70122 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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