Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcbP68404 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms