Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms