Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms