Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdhd1P59328 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdhd1P59328 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms