Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scarf2P59222 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms