Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uchl4P58321 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Uchl4P58321 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Uchl4P58321 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Uchl4P58321 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Uchl4P58321 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uchl4P58321 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Uchl4P58321 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Uchl4P58321 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Uchl4P58321 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Uchl4P58321 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Uchl4P58321 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms