Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms