Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms