Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TdgP56581 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TdgP56581 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms