Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb41l4aP52963 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms