Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lbx1P52955 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lbx1P52955 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms