Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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