Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmod1P49813 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms