Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms