Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms