Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms