Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mmp9P41245 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mmp9P41245 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mmp9P41245 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mmp9P41245 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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