Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl28P41105 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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