Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VhlP40338 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VhlP40338 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms