Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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