Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rfc1P35601 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rfc1P35601 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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