Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PpardP35396 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PpardP35396 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PpardP35396 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PpardP35396 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms