Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk4P30285 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk4P30285 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms