Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VtnP29788 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VtnP29788 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
VtnP29788 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VtnP29788 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms