Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TbpP29037 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TbpP29037 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TbpP29037 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms