Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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