Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms